MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 6056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015183	T	7	7	2040272	2040278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_015183	TGA	2	6	2040298	2040303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_015183	AAT	2	6	2040307	2040312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_015183	T	6	6	2040343	2040348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_015183	TGC	2	6	2040365	2040370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_015183	CAA	2	6	2040429	2040434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_015183	AGG	2	6	2040436	2040441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_015183	TC	3	6	2040462	2040467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_015183	GAT	2	6	2040506	2040511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_015183	T	6	6	2040603	2040608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_015183	A	6	6	2042667	2042672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_015183	GGGC	2	8	2042684	2042691	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4513	NC_015183	CTC	2	6	2049303	2049308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_015183	CAT	2	6	2049309	2049314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_015183	CAA	2	6	2049417	2049422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_015183	A	6	6	2049421	2049426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_015183	ATG	2	6	2050306	2050311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_015183	AAT	2	6	2051210	2051215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_015183	CTA	2	6	2051226	2051231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_015183	GT	3	6	2051299	2051304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_015183	AAT	2	6	2054716	2054721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_015183	CAG	2	6	2054733	2054738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_015183	TGA	2	6	2055485	2055490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_015183	TG	3	6	2055583	2055588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_015183	ACA	2	6	2055590	2055595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_015183	GGC	2	6	2059974	2059979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_015183	GCC	2	6	2059989	2059994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_015183	TC	3	6	2061529	2061534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_015183	A	8	8	2061543	2061550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_015183	GCCA	2	8	2061551	2061558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_015183	CGCA	2	8	2061622	2061629	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_015183	CTG	2	6	2061631	2061636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_015183	GCC	2	6	2061719	2061724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_015183	CCG	2	6	2062539	2062544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_015183	TTC	2	6	2062558	2062563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_015183	TAG	2	6	2063570	2063575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_015183	CCG	2	6	2063600	2063605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_015183	ATG	3	9	2063686	2063694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_015183	ATAA	2	8	2063765	2063772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_015183	A	6	6	2063848	2063853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_015183	CTT	2	6	2065002	2065007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_015183	ATA	2	6	2065109	2065114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_015183	AGAC	2	8	2065126	2065133	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4544	NC_015183	CGA	2	6	2067956	2067961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_015183	AT	3	6	2069738	2069743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_015183	AATAT	2	10	2069840	2069849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_015183	CTC	2	6	2069851	2069856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_015183	CCG	2	6	2069859	2069864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_015183	AAG	2	6	2070753	2070758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_015183	ACG	2	6	2072103	2072108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_015183	A	6	6	2072113	2072118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_015183	CAA	2	6	2072147	2072152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_015183	AT	3	6	2076009	2076014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_015183	AGGTAT	2	12	2076020	2076031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_015183	CGT	2	6	2076039	2076044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_015183	GCA	2	6	2076087	2076092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_015183	AGC	2	6	2076107	2076112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_015183	GGA	2	6	2076122	2076127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_015183	ACG	2	6	2078141	2078146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_015183	CAA	2	6	2078206	2078211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_015183	AGC	2	6	2078227	2078232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_015183	TCC	2	6	2078736	2078741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_015183	C	6	6	2078828	2078833	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4564	NC_015183	GGC	2	6	2078880	2078885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_015183	CGC	2	6	2078915	2078920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_015183	CCG	2	6	2079007	2079012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4567	NC_015183	AT	3	6	2079040	2079045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_015183	CGC	2	6	2079774	2079779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4569	NC_015183	CAT	2	6	2079867	2079872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_015183	TGA	2	6	2080307	2080312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_015183	T	6	6	2080344	2080349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_015183	GAT	2	6	2080386	2080391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_015183	TGG	2	6	2080444	2080449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_015183	GA	3	6	2080455	2080460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_015183	CCAA	2	8	2080470	2080477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4576	NC_015183	GCC	2	6	2080488	2080493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_015183	TGCCGT	2	12	2080627	2080638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_015183	GCG	2	6	2081452	2081457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_015183	CGC	2	6	2081466	2081471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_015183	C	6	6	2081527	2081532	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4581	NC_015183	T	8	8	2081557	2081564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_015183	CG	3	6	2081569	2081574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4583	NC_015183	ACTC	2	8	2081991	2081998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4584	NC_015183	GTTT	2	8	2082000	2082007	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_015183	CCCG	2	8	2082052	2082059	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4586	NC_015183	CAG	2	6	2082086	2082091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_015183	GGC	2	6	2082671	2082676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_015183	A	6	6	2082714	2082719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_015183	GAC	2	6	2082772	2082777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_015183	GA	3	6	2082813	2082818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_015183	GGA	2	6	2085446	2085451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_015183	TCG	2	6	2085466	2085471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_015183	CA	3	6	2086521	2086526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4594	NC_015183	A	6	6	2086562	2086567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_015183	CCG	2	6	2088706	2088711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_015183	TGCT	2	8	2088842	2088849	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4597	NC_015183	GCA	2	6	2089018	2089023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_015183	CGC	2	6	2091160	2091165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4599	NC_015183	CAT	2	6	2091198	2091203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_015183	A	6	6	2091207	2091212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_015183	GCT	2	6	2091291	2091296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_015183	CCG	2	6	2091350	2091355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4603	NC_015183	TCG	2	6	2091366	2091371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_015183	GCA	2	6	2091372	2091377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_015183	GGCAG	2	10	2091382	2091391	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4606	NC_015183	CTGCC	2	10	2091398	2091407	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4607	NC_015183	TTC	3	9	2091886	2091894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_015183	CAAAT	2	10	2091984	2091993	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4609	NC_015183	AGC	2	6	2092060	2092065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_015183	CG	3	6	2092125	2092130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_015183	A	6	6	2092157	2092162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_015183	GCA	2	6	2094910	2094915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_015183	TGA	2	6	2094918	2094923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_015183	ATT	2	6	2095141	2095146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_015183	GGA	2	6	2097346	2097351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_015183	GAGC	2	8	2097408	2097415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_015183	GATC	2	8	2097458	2097465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4618	NC_015183	TC	3	6	2098940	2098945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_015183	GAA	2	6	2099003	2099008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_015183	GGTG	2	8	2099015	2099022	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_015183	GAAA	2	8	2099573	2099580	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_015183	GC	3	6	2100520	2100525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4623	NC_015183	CCGG	2	8	2100527	2100534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_015183	CTGG	2	8	2100547	2100554	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_015183	GA	3	6	2100581	2100586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_015183	TCA	2	6	2100621	2100626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_015183	GAAG	2	8	2100700	2100707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_015183	CCA	2	6	2100744	2100749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_015183	GCC	2	6	2104084	2104089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4630	NC_015183	CGC	2	6	2104107	2104112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4631	NC_015183	GCG	2	6	2104124	2104129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_015183	AATA	2	8	2105319	2105326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_015183	GAT	2	6	2105412	2105417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_015183	ATAGC	2	10	2105426	2105435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4635	NC_015183	AC	3	6	2105437	2105442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4636	NC_015183	GTC	2	6	2108235	2108240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4638	NC_015183	CTGAA	2	10	2108877	2108886	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4663	NC_015183	GC	3	6	2113596	2113601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4664	NC_015183	CGC	2	6	2114774	2114779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4750	NC_015183	TAA	2	6	2148064	2148069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4751	NC_015183	AGCAT	2	10	2148076	2148085	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4752	NC_015183	TTGTCT	2	12	2148105	2148116	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4753	NC_015183	TAT	2	6	2148125	2148130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4754	NC_015183	CAGA	2	8	2148877	2148884	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4755	NC_015183	CCGTT	2	10	2148900	2148909	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4756	NC_015183	CGC	2	6	2148960	2148965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4760	NC_015183	GTG	2	6	2152337	2152342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4761	NC_015183	ACA	2	6	2152343	2152348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4763	NC_015183	TGA	2	6	2153931	2153936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4894	NC_015183	ATG	2	6	2207255	2207260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4895	NC_015183	AT	3	6	2207270	2207275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4896	NC_015183	T	6	6	2207300	2207305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4897	NC_015183	GCGCG	2	10	2207364	2207373	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4898	NC_015183	GC	3	6	2207379	2207384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4899	NC_015183	GC	4	8	2207395	2207402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4900	NC_015183	CAT	2	6	2209674	2209679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4903	NC_015183	TGG	3	9	2210761	2210769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4909	NC_015183	CGG	2	6	2213096	2213101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4911	NC_015183	CTG	2	6	2213154	2213159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4912	NC_015183	TTCC	2	8	2214120	2214127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4913	NC_015183	AACC	2	8	2214169	2214176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4914	NC_015183	T	6	6	2214259	2214264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4915	NC_015183	AT	3	6	2214272	2214277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4916	NC_015183	AAC	2	6	2214313	2214318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4938	NC_015183	TCG	2	6	2223950	2223955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4949	NC_015183	CG	3	6	2228665	2228670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4950	NC_015183	GA	3	6	2228673	2228678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4951	NC_015183	GCTG	2	8	2228703	2228710	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4955	NC_015183	CGCC	2	8	2229618	2229625	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4956	NC_015183	TAA	2	6	2229630	2229635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4958	NC_015183	ACGG	2	8	2230734	2230741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4959	NC_015183	GCCC	2	8	2230868	2230875	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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4961	NC_015183	CG	3	6	2236600	2236605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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